Silvio Merkaj nasce a Valona, in Albania, il 4 dicembre 1997. Muove i suoi primi passi nel Foligno, squadra con cui realizza i suoi primi gol in Serie D. Silvio Merkaj è un attaccante robusto, alto 1,88 metri, ma capace anche di giocare come esterno d’attacco.

Al suo debutto in Serie D ha realizzato il primo gol contro L’Aquila. Al suo primo anno, su 12 partite, ha messo a segno quattro reti. Nel 2017 passa dal Foligno all’Igea, squadra siciliana con cui colleziona 33 presenze e firma quattro gol e quattro assist.

L’anno successivo si trasferisce al Gelbison, in provincia di Salerno. Con i rossoblu realizza otto reti in 32 presenze prima di passare al Bitonto. Dopo la stagione 2019/20 in Puglia, Merkaj diventa un giocatore della Polisportiva Vastogirardi. L’annata 2020/21 è condita da 32 presenze, quattordici gol e quattro assist.

Nel giugno del 2021 passa tra i professionisti. La Virtus Entella, retrocessa dalla Serie B, lo mette sotto contratto fino al 30 giugno 2024. Allenamento dopo allenamento, Silvio Merkaj si ritaglia uno spazio importante e la fiducia di mister Volpe, che inizia a schierarlo continuamente.

Dopo un inizio in sordina, il 31 ottobre segna il suo primo gol in Serie C contro l’Imolese. Da lì, prende l’abbrivio. Una doppietta al Cesena, due gol consecutivi in trasferta contro Fermana e Teramo, una doppietta all’Olbia e tre gol consecutivi tra Carrarese, Imolese e Ancona. Finora, al suo primo campionato tra i professionisti, in 30 gare ha collezionato 18 presenze da titolare, 4 assist e 10 reti.